|
UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA Av. Pará, 1720, Bloco 2E - Bairro Umuarama, Uberlândia-MG, CEP 38400-902 |
|
Plano de Ensino
IDENTIFICAÇÃO
Componente Curricular: |
|||||||||
Unidade Ofertante: |
|||||||||
Código: |
Período/Série: |
Turma: |
|||||||
Carga Horária: |
Natureza: |
||||||||
Teórica: |
Prática: |
Total: |
Obrigatória: |
Optativa: |
|||||
Professor(A): |
Ano/Semestre: |
||||||||
Observações: |
EMENTA
Estruturas tridimensionais, domínios funcionais, design de sondas moleculares e anotação de genomas e genes. Proteômica. Análise de sequências. A Modelagem Molecular (MM) compreende um número de ferramentas e métodos computacionais e teóricos que tem como objetivo entender e prever o comportamento de sistemas reais; usadas para descrever e prever estruturas moleculares, propriedades do estado de transição e equilíbrio de reações, propriedades termodinâmicas, entre outras.
JUSTIFICATIVA
Modelagem Molecular é uma disciplina que abrange aspectos da Bioinformática e Biologia Estrutural, tópicos estes cada vez mais importantes na pesquisa de ponta, seja na academia ou na indústria. Ao longo da disciplina os alunos entraram em contato com as ferramentas e métodos em MM visando a predição e avaliação de estruturas proteicas assim como o uso de técnicas de interação receptor-ligante e “screening virtual”.
OBJETIVO
Objetivo Geral: |
Esta disciplina tem como objetivo colocar os alunos em contato com os recentes avanços no campo da bioinformática estrutural e suas aplicações na estrutura de proteínas. |
Objetivos Específicos: |
Compreender e aplicar os conceitos em: - Fundamentos da estrutura proteica; - Interações atômicas e Funções de pontuação; - Métodos de modelagem molecular; - Validação de modelos tridimensionais; - Interações receptor-ligante.
|
PROGRAMA
As aulas serão realizadas às quartas-feiras, das 8:00 às 9:40, segundo o seguinte planejamento: |
|
DIA |
MATÉRIA A SER LECIONADA |
04/MAI |
INTRODUÇÃO A MODELAGEM MOLECULAR |
11/MAI |
FUNDAMENTOS DA ESTRUTURA PROTEICA |
18/MAI |
FUNDAMENTOS DA ESTRUTURA PROTEICA (PRÁTICA) |
25/MAI |
INTERAÇÕES ATÔMICAS E FUNÇÕES DE PONTUAÇÃO |
01/JUN |
INTERAÇÕES ATÔMICAS E FUNÇÕES DE PONTUAÇÃO (PRÁTICA) |
08/JUN |
PROVA 1 |
15/JUN |
MÉTODOS DE MODELAGEM MOLECULAR |
22/JUN |
MÉTODOS DE MODELAGEM MOLECULAR (PRÁTICA) |
29/JUN |
VALIDAÇÃO DE MODELOS TRIDIMENSIONAIS |
06/JUL |
VALIDAÇÃO DE MODELOS TRIDIMENSIONAIS (PRÁTICA) |
13/JUL |
PROVA 2 |
20/JUL |
INTERAÇÕES RECEPTOR-LIGANTE |
27/JUL |
INTERAÇÕES RECEPTOR-LIGANTE (PRÁTICA) |
03/AGO |
PROVA 3 |
10/AGO |
SEMINÁRIO |
17/AGO |
RECUPERAÇÃO |
METODOLOGIA
As aulas serão ministradas de forma expositiva dialogadas com auxílio de data-show e lousa.
AVALIAÇÃO
As provas serão sem consulta. Os exercícios podem ser realizados em dupla.
Avaliação Valor Data
1ª Prova 30,0 08/06/2022
2ª Prova 30,0 13/07/2022
3ª Prova 10,0 03/08/2022
Seminário 30,0 10/08/2022
Total 100
A soma das notas das três avaliações e do seminário devem ser superior a 60,0. Se for inferior, o aluno estará reprovado na disciplina.
No dia 17/08 haverá prova de recuperação com todo conteúdo da matéria valendo 50 pontos.
Os resultados das avaliações serão divulgados por e-mail e/ou no mural do curso.
BIBLIOGRAFIA
Básica
GU, J. & BOURNE, P.E. Structural Bioinformatics. 2nd edition. Wiley-Blackwell, 2009.
RIGDEN, D.J. From Protein Structure to Function with Bioinformatics. Springer, 2009.
SCHWEDE, T. & PEITSCH, M. Computational Structural Biology: Methods and Applications. World Scientific Publishing Company, 2008.
SOTRIFFER, C. et al. Virtual Screening: Volume 48 - Principles, Challenges, and Practical Guidelines. Wiley-VCH, 2011.
Complementar
WHITFORD, D. Proteins: Structure and Function. John Wiley & Sons, 2005.
BRANDEN, C. & TOOZE, J. Introduction to Protein Structure. 2nd edition. Garland Science, 2009.
KUKOL, A. Molecular Modeling of Proteins. Humana Press, 2008.
BUJNICKI, J.M. Prediction of Protein Structures, Functions, and Interactions. John Wiley & Sons, 2009.
SUNDSTRÖM, M., NORIN, M., EDWARDS, A. Structural. Genomics and High Throughput Structural Biology. Taylor & Francis, 2009.
WU, Z. Lecture Notes on Computational Structural Biology. World Scientific Publishing, 2008.
APROVAÇÃO
Aprovado em reunião do Colegiado realizada em: ____/____/______
Coordenação do Curso de Graduação: _________________________
Documento assinado eletronicamente por Nilson Nicolau Junior, Professor(a) do Magistério Superior, em 14/04/2022, às 11:26, conforme horário oficial de Brasília, com fundamento no art. 6º, § 1º, do Decreto nº 8.539, de 8 de outubro de 2015. |
A autenticidade deste documento pode ser conferida no site https://www.sei.ufu.br/sei/controlador_externo.php?acao=documento_conferir&id_orgao_acesso_externo=0, informando o código verificador 3512962 e o código CRC BF7C18DE. |
Referência: Processo nº 23117.023194/2022-23 | SEI nº 3512962 |